金鱼变色的原因主要受其遗传基因的控制，随着身体的发育，金鱼的基本色会逐渐发生改变，在其一生中可能会发生数次变色。例如，幼苗时的金鱼身体呈青灰色，而在五个月的鱼龄左右，它们可能开始变色，展现出红、白、黑、五花等不同的色系。白色和五花金鱼的变色较早开始，从孵化后一个月即可能开始变色，短的变色期为25天，而长的可能需要一两个月。
除了遗传因素外，金鱼的体色也可能受到环境因素的影响。例如，水温对金鱼的体色有很大的影响，如果水温不合适，可能会使金鱼的颜色发生变化。此外，不良的水质也可能导致金鱼的体色发生变化。值得注意的是，金鱼的红色体色并不是直接来源于红色细胞，而是来源于橙色体色细胞，因此其红色效果只能极大限度地接近红色。
